FBI je priznal, da je na dan protesta na Kapitolu 6. januarja 2021 "skrivaj napotil" 274 agentov v civilu. Agenti so se pomešali med protestnike, opazovali dogajanje za barikadami in vstopili v Kapitol, pri čemer niso nosili uniform, se niso identificirali in niso bili javno odgovorni. Številka agentov je bila vrsto let prikrita, kar je sprožilo kritike glede transparentnosti in odgovornosti FBI.

FBI je odpustil najmanj 15 agentov, ki so bili fotografirani med klečanjem na protestih Black Lives Matter v Washingtonu leta 2020. Razlog za odpustitev je "pomanjkanje presoje".

FBI je preiskal dom nekdanjega svetovalca za nacionalno varnost Donalda Trumpa, Johna Boltona, in zasegel več računalnikov, telefonov, USB ključkov in dokumentov. Preiskava je del kriminalistične preiskave o nepooblaščenem odstranjevanju in zadrževanju tajnih dokumentov ter nepravilnem zbiranju, prenosu ali izgubi podatkov o nacionalni obrambi. Dokumenti so povezani z Boltonovo knjigo spominov iz leta 2020.