Trumpova administracija je bila deležna kritik zaradi predlaganih sprememb financiranja univerz in znanstvenih raziskav. Poroča se, da se Harvardska univerza pogaja o poravnavi v višini 500 milijonov ameriških dolarjev, da bi končala preiskavo o antisemitizmu in sprostila zamrznjena zvezna sredstva. Hkrati pa so bila plemenska visoke šole izpostavljene kot potencialne žrtve Trumpovih predlogov o zmanjšanju sredstev. Poleg tega strokovnjaki opozarjajo, da Trumpova protiznanstvena agenda ovira načrte za razvoj umetne inteligence, saj zmanjševanje proračuna povzroča odpuščanja in neučinkovitost zveznih programov.

Novi nadzornik javnih šol v Oklahomi, Lindel Fields, je razveljavil mandat svojega predhodnika, ki je šole silil k vključevanju Biblije v učne načrte. Medtem so se pojavile obtožbe, da je nekdanji državni nadzornik Ryan Walters nezakonito dodeljeval zvezna sredstva za pomoč zaradi COVID-19 verskim zasebnim šolam, ki niso izpolnjevale pogojev. To je vzbudilo zaskrbljenost ameriškega ministrstva za izobraževanje pod vodstvom predsednika Trumpa.

Univerza Stanford je odpustila več kot 360 zaposlenih, kot razlog pa navaja proračunske omejitve zaradi zveznih politik financiranja, ki jih je uvedel ameriški predsednik Donald Trump. Administracija je grozila z zmanjšanjem sredstev za številne ameriške univerze, kar je povzročilo finančne težave za Stanford.